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邵丹

2022年06月06日 08:38  点击:[]

  

姓名:邵丹

学历:博士研究生

职称教授

邮箱:shaodan@ccu.edu.cn


研究方向及主要研究内容:

大数据智能计算、网络通信安全、社会安全、生物信息学

    

学术兼职:

CCF教育专委委员、Briefings in Bioinformatics期刊审稿人

 


 

 


 

 

承担过的主要科研项目:

 

主要研究焦点为生物信息、大数据智能计算、数据通信,先后主持和参与国家自然科学基金面上项目、吉林省自然科学基金面上项目、吉林省科技重点研发项目、吉林省重大科技攻关项目等10余项,包括:

1)吉林省科技厅重点研发项目,20220203057SF基于数据分析的智慧消防安全管理系统研究,2022-01至今,20,在研,主持

2)吉林省科技厅,自然基金面上项目,20230101236JC基于PPI网络的肺癌体液标志物深度挖掘与机理分析,2023-01至今,10,在研,主持

3)吉林省科技厅,重大科技攻关项目,20130206040GX车联网的微观测试平台关键理论与技术研究, 2013-012015-1220,结项,主持

4)吉林省教育厅,自然科学项目,JJKH20200575KJ基于深度神经网络的血液蛋白质预测关键技术研究2020-012021-122.5万,结项,主持。

5)吉林省教育厅,自然科学项目,2014LY505L26,缩微智能车互联通信关键理论与技术研究,2014-012015-124万,结项,主持。

6国家自然科学基金委员会,面上项目62072212融合多组学数据的胰腺癌体液标志物精准挖掘与机理研究2021-012024-1257万,在研,参加。



 

获得的主要科研成果(论文、获奖、专利):

1. 获奖

1学术奖励: 吉林省科技进步三等奖:基于缩微平台的车联网通信与安全关键技术研究与应用,排名第1,吉林省科学技术奖励委员会,2020.

2学术奖励: 吉林省科技进步三等奖:基于RFID与二维码技术的汽车零部件质量可视化监控与溯源系统,排名第5,吉林省人民政府,2022.

3教学奖励: 吉林省教学成果二等奖:产学深度融合模式下计算机专业卓越工程师培养的探索与实践,排名第2,吉林省人民政府,2018.

2. 代表性论文

(1) Dan Shao, Yinfei Dai, Nianfeng Li, Xuqing Cao, Wei Zhao, Li Cheng, Zhuqing Rong, Lan Huang, Yan Wang, Jing Zhao. Artificial Intelligence in Clinical Research of Cancers. Briefings in Bioinformatics. 2022; 23:1-12.中科院一区SCIIF 13.994

(2) Dan Shao, Lan Huang, Yan Wang, Kai He, Xueteng Cui, Yao Wang, Qin Ma, Juan Cui. DeepSec: a deep learning framework for secreted protein discovery in human body fluids. Bioinformatics, 2022; 38:228-235.中科院二区SCIIF 6.9

(3) Dan Shao, Lan Huang, Yan Wang, Xueteng Cui, Yufei Li, Yao Wang, Qin Ma, Wei Du, Juan Cui. HBFP: a new repository for Human Body-Fluid Proteome. Database. 2021; baab065.中科院二区SCIIF 3.45)

(4) Dan Shao, Lan Huang, Yan Wang, Xueteng Cui, Kai He, Yao Wang. Computational Prediction of Human Body-Fluid Protein. 2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). 2019; 2735-2740.CCF B

(5) Lan Huang, Yanli Qu, Kai He, Yan Wang, Dan Shao*. DenSec: secreted protein prediction in cerebrospinal fluid based on SenseNet and Transformer. Mathematics. 2022; 10:2490.中科院三区SCIIF 2.59)

(6) Lan Huang, Dan Shao, Yan Wang, Xueteng Cui, Yufei Li, Qian Chen, Juan Cui. Human body-fluid proteome: quantitative profiling and computational prediction. Briefings in Bioinformatics. 2021; 22:315-333.中科院一区SCIIF 13.994

(7) Sen Yang, Yan Wang, Yu Lin, Dan Shao. LncMirNet: predicting LncRNA-miRNA interaction based on deep learning of ribonucleic acid sequences. Molecules. 2022; 25:4372.中科院二区SCIIF 4.4

(8) Kai He, Yan Wang, Xuping Xie, Dan Shao. MultiSec: multi-task deep learning improves secreted protein discovery in human body fluids. Mathematics. 2022;10:2562.中科院SCIIF 2.59)

(9) Kai He, Yan Wang, Xuping Xie, Dan Shao. Prediction of proteins in cerebrospinal fluid and application to glioma biomarker identification. Molecules. 2023;28:3617.中科院SCIIF 4.927)

3. 获批发明专利

1邵丹、王岩、黄岚、何凯、崔薛腾、张双全,基于深层神经网络的脑脊液蛋白质的预测方法,2021-05-25,中国,ZL 201911073760.4

2)黄岚、邵丹、王岩、何凯、杨森、白天,基于卷积神经网络的精液蛋白质的预测方法,2021-03-02,中国,ZL 201911073759.1

3)王岩、何凯、邵丹、黄岚、王尧、张睿,基于循环神经网络的羊水蛋白质的预测方法,2021-04-16,中国,ZL 201911073779.9



 

主讲课程及授课对象

 

1.计算机网络,本科

2.高级路由协议,本科

3.网络互连技术,本科

4.网络空间安全概论,研究生

 

培养研究生情况

指导研究生6人



 




 




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